吉林动画学院根据国家文化事业、产业发展和通用航空产业发展趋势，以及应用型人才培养需要，紧密依托产业群组建专业群，按照产业链布局设置培养方向，调整专业结构，优化资源配置，实现专业（集群）与产业群的有效对接。学校现有11个学院和覆盖文学、艺术学、工学、管理学四个学科门类共29个本科专业、55个培养方向。形成以动漫游类专业为龙头，其它艺术类专业为主体，文学、管理学、工学协调发展，优势互补，相互支撑的学科专业布局。
吉林动画学院本科专业及培养方向设置表(2017)
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动画策划设计、影视动画、新媒体动画、影视特效、动画衍生品开发设计、动画管理与营销
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动画技术、影视特效技术、游戏引擎开发与应用技术、虚拟现实技术、增强现实技术
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